Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EEF1DP3Q658K8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms