Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SHEQ5VZ18 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms