Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRCH2Q5VUJ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRCH2Q5VUJ6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms