Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LDLRAD1Q5T700 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LDLRAD1Q5T700 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD1Q5T700 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD1Q5T700 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD1Q5T700 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD1Q5T700 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD1Q5T700 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD1Q5T700 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LDLRAD1Q5T700 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms