Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN11Q5T124 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms