Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARCH8Q5T0T0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms