Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms