Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC27A3Q5K4L6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC27A3Q5K4L6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms