Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PCID2Q5JVF3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms