Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SDK2Q58EX2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SDK2Q58EX2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms