Protein–RNA interactions for Protein: Q53T59

HS1BP3, HCLS1-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS1BP3Q53T59 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HS1BP3Q53T59 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS1BP3Q53T59 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms