Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COBLL1Q53SF7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms