Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SLC9B1Q4ZJI4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC9B1Q4ZJI4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC9B1Q4ZJI4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SLC9B1Q4ZJI4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms