Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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KRTAP13-3Q3SY46 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP13-3Q3SY46 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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