Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC57Q2TAC2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC57Q2TAC2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms