Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM1Q2NKQ1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms