Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FXNQ16595 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FXNQ16595 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FXNQ16595 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FXNQ16595 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FXNQ16595 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FXNQ16595 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms