Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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