Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC85BQ15834 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85BQ15834 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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