Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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