Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PTPRKQ15262 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PTPRKQ15262 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
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