Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDGFRLQ15198 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDGFRLQ15198 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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