Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HERPUD1Q15011 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERPUD1Q15011 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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