Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.571e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.531e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 218.3■□□□□ 0.521e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 EPHB4-203ENST00000467515 709 ntTSL 217.93■□□□□ 0.461e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.351e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 EPHB4-206ENST00000487222 5058 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.31e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 MAN2C1-233ENST00000566569 848 ntTSL 516.37■□□□□ 0.211e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.151e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TCF25-221ENST00000568409 857 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-10■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 MAN2C1-205ENST00000562067 710 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 MAN2C1-221ENST00000564929 851 ntTSL 514.98□□□□□ -0.011e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 EPHB4-202ENST00000360620 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-213ENST00000433212 3474 ntTSL 514.07□□□□□ -0.161e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.161e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-212ENST00000429178 3701 ntTSL 1 (best)13.21□□□□□ -0.31e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-206ENST00000413171 4488 ntTSL 512.86□□□□□ -0.351e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.371e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 312.11□□□□□ -0.471e-10■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.481e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-205ENST00000405266 4062 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.531e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-210ENST00000425407 3868 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.591e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.621e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.651e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.671e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SUN1-229ENST00000475971 4038 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.771e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PRKAR1A-202ENST00000392710 3551 ntTSL 27.96□□□□□ -1.131e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.231e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.351e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 KYAT3-204ENST00000446900 1937 ntTSL 53.46□□□□□ -1.861e-5■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 A2M-212ENST00000545828 471 ntTSL 46.34□□□□□ -1.398e-35■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt16.33■□□□□ 0.29e-10■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 215.14■□□□□ 0.019e-10■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 DAZAP1-203ENST00000585485 3943 ntTSL 214.96□□□□□ -0.029e-10■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.654e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.094e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.094e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.564e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SEPT8-210ENST00000448933 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.164e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SEPT8-213ENST00000481030 790 ntTSL 312.33□□□□□ -0.444e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.823e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.793e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-218ENST00000636639 2125 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.673e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.63e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-219ENST00000636787 2012 ntTSL 518.54■□□□□ 0.563e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.563e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.513e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.473e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.473e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-209ENST00000635774 1995 ntTSL 517.88■□□□□ 0.453e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-216ENST00000636574 2027 ntTSL 517.47■□□□□ 0.393e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.353e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.263e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.243e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-208ENST00000635734 1851 ntTSL 515.56■□□□□ 0.083e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 RPLP0-208ENST00000547191 680 ntTSL 511.21□□□□□ -0.613e-15■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-231ENST00000637955 1084 ntTSL 58.56□□□□□ -1.043e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-210ENST00000635829 2479 ntTSL 57.78□□□□□ -1.163e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP6AP2-223ENST00000637165 534 ntTSL 55.99□□□□□ -1.453e-9■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC5.46□□□□□ -1.541e-323■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP5F1-201ENST00000369721 1040 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-6■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP5F1-204ENST00000468818 859 ntTSL 35.42□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TGFBI-215ENST00000604555 1173 ntTSL 216.31■□□□□ 0.27e-14■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TGFBI-209ENST00000509485 731 ntTSL 312.65□□□□□ -0.387e-14■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TGFBI-214ENST00000515433 4661 ntTSL 211.51□□□□□ -0.577e-14■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TGFBI-208ENST00000508767 582 ntTSL 36.57□□□□□ -1.367e-14■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 ATP1A1-209ENST00000491156 666 ntTSL 28.97□□□□□ -0.973e-11■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TFRC-204ENST00000421258 524 ntTSL 313.96□□□□□ -0.172e-6■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 TFRC-208ENST00000464011 546 ntTSL 411.18□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 RPS21-205ENST00000492356 429 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 RPS21-204ENST00000450116 418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-7■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 PDIA6-206ENST00000489662 564 ntTSL 414.07□□□□□ -0.161e-10■□□□□ 10.6
NOLC1Q14978 FN1-214ENST00000460217 804 ntTSL 211.71□□□□□ -0.532e-62■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.386e-31■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.546e-31■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 RPL22-207ENST00000484532 449 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.038e-35■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 SNORD88A-201ENST00000408314 91 ntBASIC9.95□□□□□ -0.821e-323■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 RPL18-211ENST00000550973 1111 ntTSL 522.42■■□□□ 1.182e-6■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 RPL18-212ENST00000551749 2091 ntTSL 220.23■□□□□ 0.832e-6■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 RPL18-213ENST00000552347 1645 ntTSL 519.56■□□□□ 0.722e-6■□□□□ 10.5
NOLC1Q14978 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-6■□□□□ 10.5
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