Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIXQ14938 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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