Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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