Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC1AQ14683 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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