Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CKAP5Q14008 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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CKAP5Q14008 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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CKAP5Q14008 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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CKAP5Q14008 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CKAP5Q14008 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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