Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CBFBQ13951 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBFBQ13951 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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