Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CACNA1CQ13936 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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