Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2H3Q13889 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2H3Q13889 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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