Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GTF2H2Q13888 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GTF2H2Q13888 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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GTF2H2Q13888 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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GTF2H2Q13888 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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GTF2H2Q13888 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GTF2H2Q13888 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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