Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4AQ13619 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4AQ13619 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms