Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SF3B2Q13435 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SF3B2Q13435 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
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