Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB3BPQ13352 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB3BPQ13352 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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