Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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