Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GRIN2BQ13224 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
GRIN2BQ13224 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GRIN2BQ13224 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms