Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPRL3Q12980 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPRL3Q12980 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NPRL3Q12980 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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NPRL3Q12980 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NPRL3Q12980 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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