Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FOXF2Q12947 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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