Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TROQ12816 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TROQ12816 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TROQ12816 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TROQ12816 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TROQ12816 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TROQ12816 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TROQ12816 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TROQ12816 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TROQ12816 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TROQ12816 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TROQ12816 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TROQ12816 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
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