Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YPL276WYPL276W 438 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YSY6YBR162W-A 198 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 BUB1YGR188C 3066 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 DYN1YKR054C 12279 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 EXO84YBR102C 2262 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 BOI1YBL085W 2943 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 ATG13YPR185W 2217 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RIX1YHR197W 2292 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 TAO3YIL129C 7131 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 PEP8YJL053W 1140 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YPR039WYPR039W 336 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 MSL5YLR116W 1431 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 GYP7YDL234C 2241 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YPL150WYPL150W 2706 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 COG3YER157W 2406 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 ATP17YDR377W 306 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 DYN2YDR424C 279 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RPL40BYKR094C 387 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RNP1YLL046C 750 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 FLO1YAR050W 4614 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 LEU3YLR451W 2661 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 GNT1YOR320C 1476 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YER138CYER138C 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YER160CYER160C 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YJR027WYJR027W 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YML039WYML039W 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YML045WYML045W 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YMR050CYMR050C 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RTT102YGR275W 474 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 PET191YJR034W 327 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 JIP3YLR331C 378 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 RPS7BYNL096C 573 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 AI2Q0055 2565 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YNL034WYNL034W 1839 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 AYT1YLL063C 1425 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 TAF2YCR042C 4224 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 ECM5YMR176W 4236 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 TOM70YNL121C 1854 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 UBC7YMR022W 498 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YBL108WYBL108W 306 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YOR121CYOR121C 306 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YHR078WYHR078W 1659 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 YLR278CYLR278C 4026 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 SSY1YDR160W 2559 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 MKT1YNL085W 2493 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB4Q12246 TFC1YBR123C 1950 nt2.78□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 FUS1YCL027W 1539 nt2.78□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 KAP104YBR017C 2757 nt2.78□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 TFC4YGR047C 3078 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YSW1YBR148W 1830 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 REV3YPL167C 4515 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 MED1YPR070W 1701 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 NDD1YOR372C 1665 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 GPI8YDR331W 1236 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 RPS17BYDR447C 411 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YKR033CYKR033C 426 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 MRPL50YNR022C 420 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 SNX41YDR425W 1878 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 ESL1YIL151C 3357 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 DIE2YGR227W 1578 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YGR035CYGR035C 351 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 FYV4YHR059W 393 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YIL054WYIL054W 318 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 TIM8YJR135W-A 264 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 RPS1AYLR441C 768 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 ICY1YMR195W 384 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 ESF2YNR054C 951 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 GIS4YML006C 2325 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 SPB1YCL054W 2526 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 GCD10YNL062C 1437 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 INP52YNL106C 3552 nt2.75□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 snR70snR70 164 nt2.75□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YMR31YFR049W 372 nt2.75□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.75□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.75□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 YOR199WYOR199W 330 nt2.75□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 DBP7YKR024C 2229 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 BNA4YBL098W 1383 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 ESL2YKR096W 3588 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 SPC72YAL047C 1869 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB4Q12246 RMT2YDR465C 1239 nt2.74□□□□□ -1.97
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