Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 MNE1YOR350C 1992 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 RSM28YDR494W 1086 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 RPL37BYDR500C 267 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 LOC1YFR001W 615 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YHR210CYHR210C 1026 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 EST3YIL009C-A 546 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YJL147CYJL147C 1149 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YLR217WYLR217W 324 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 URA5YML106W 681 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YOR333CYOR333C 417 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 SUS1YBR111W-A 291 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 GAL80YML051W 1308 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 SHS1YDL225W 1656 nt1.58□□□□□ -2.16
USB1Q12208 NAM7YMR080C 2916 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 RSM27YGR215W 333 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 CAP1YKL007W 807 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YET1YKL065C 621 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 SHE2YKL130C 741 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 GIM3YNL153C 390 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 TOA1YOR194C 861 nt1.57□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YDR341CYDR341C 1824 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 LEU3YLR451W 2661 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 VPS35YJL154C 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 CDC50YCR094W 1176 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 PAU3YCR104W 375 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YDR018CYDR018C 1191 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 PRS3YHL011C 963 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 PAI3YMR174C 207 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 PKH3YDR466W 2697 nt1.56□□□□□ -2.16
USB1Q12208 SYH1YPL105C 2550 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YDR248CYDR248C 582 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 BRX1YOL077C 876 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YOR169CYOR169C 465 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 SAR1YPL218W 573 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 ADF1YCL058W-A 342 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 UBP11YKR098C 2154 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 RTP1YMR185W 2946 nt1.55□□□□□ -2.16
USB1Q12208 ASG1YIL130W 2895 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YDR537CYDR537C 606 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YLR053CYLR053C 327 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YOL150CYOL150C 312 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 NCS2YNL119W 1482 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 GRR1YJR090C 3456 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 IRC10YOL015W 1761 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 TFC8YPL007C 1767 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YNL034WYNL034W 1839 nt1.54□□□□□ -2.16
USB1Q12208 BRR2YER172C 6492 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 ECM5YMR176W 4236 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 snR78snR78 87 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YDR115WYDR115W 318 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YGR242WYGR242W 309 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 LIN1YHR156C 1023 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 PDP3YLR455W 915 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 SFM1YOR021C 642 nt1.53□□□□□ -2.16
USB1Q12208 PTC5YOR090C 1719 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YLR422WYLR422W 5799 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 GPI8YDR331W 1236 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 RPS26BYER131W 360 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 SNC1YAL030W 354 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 TEN1YLR010C 483 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 CDC53YDL132W 2448 nt1.52□□□□□ -2.17
USB1Q12208 PEP1YBL017C 4740 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 ATG11YPR049C 3537 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 VPS38YLR360W 1320 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 AHC2YCR082W 387 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YIP1YGR172C 747 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YNL050CYNL050C 813 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 RIO2YNL207W 1278 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YNL235CYNL235C 432 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 NSL1YPL233W 651 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YBR063CYBR063C 1215 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YBR287WYBR287W 1284 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 ECM25YJL201W 1800 nt1.51□□□□□ -2.17
USB1Q12208 MEC1YBR136W 7107 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YGL042CYGL042C 306 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 MSL1YIR009W 336 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YNL226WYNL226W 411 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 ATX2YOR079C 942 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YPL034WYPL034W 498 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 ARL3YPL051W 597 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 GRX5YPL059W 453 nt1.5□□□□□ -2.17
USB1Q12208 STB4YMR019W 2850 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 KAR9YPL269W 1935 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 PRE4YFR050C 801 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 COX3Q0275 810 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 BMT5YIL096C 1011 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 YJL119CYJL119C 324 nt1.49□□□□□ -2.17
USB1Q12208 GIM5YML094W 492 nt1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms