Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 TMA20YER007C-A 546 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 AIM18YHR198C 966 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 SDL1YIL167W 633 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YJR087WYJR087W 351 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 ECM9YKR004C 1134 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YLR302CYLR302C 363 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 LSM2YBL026W 288 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 TAP42YMR028W 1101 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YNL150WYNL150W 408 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 GIM3YNL153C 390 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YOR152CYOR152C 771 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 MSS18YPR134W 807 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YCL007CYCL007C 393 nt1.94□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 GAL80YML051W 1308 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 snR9snR9 187 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 AAD16YFL057C 459 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YHR054CYHR054C 1065 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YAP5YIR018W 738 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 GIP3YPL137C 3831 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YBR197CYBR197C 654 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 APM3YBR288C 1452 nt1.93□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 VAC8YEL013W 1737 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YPR089WYPR089W 2667 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YDL009CYDL009C 324 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 COX13YGL191W 390 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 PRP21YJL203W 843 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 ATP18YML081C-A 180 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YOL029CYOL029C 606 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YBR277CYBR277C 402 nt1.92□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 DFG16YOR030W 1860 nt1.91□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YDR018CYDR018C 1191 nt1.91□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.91□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 CSE4YKL049C 690 nt1.91□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 MGA2YIR033W 3342 nt1.91□□□□□ -2.1
VIK1Q12045 VPS16YPL045W 2397 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YGR228WYGR228W 345 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 OST2YOR103C 393 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 CSM4YPL200W 471 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YPR147CYPR147C 915 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 UBR2YLR024C 5619 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 VPS41YDR080W 2979 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 ECM5YMR176W 4236 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 CDC60YPL160W 3273 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 UTP21YLR409C 2820 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RNH70YGR276C 1662 nt1.9□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 TUS1YLR425W 3924 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RTT101YJL047C 2529 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 SET2YJL168C 2202 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 TSA2YDR453C 591 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 DFG10YIL049W 762 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 VPS8YAL002W 3825 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YKL123WYKL123W 381 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RLP24YLR009W 600 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 IRC20YLR247C 4671 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 ARL3YPL051W 597 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 LRE1YCL051W 1752 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 ECM25YJL201W 1800 nt1.89□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YDL158CYDL158C 309 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 GPI8YDR331W 1236 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RAD6YGL058W 519 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 HYR1YIR037W 492 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YOR364WYOR364W 369 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RTP1YMR185W 2946 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RTT107YHR154W 3213 nt1.88□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 PES4YFR023W 1836 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 CFT2YLR115W 2580 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YDR042CYDR042C 603 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 IRC4YDR540C 540 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 SCEIQ0160 708 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YHR210CYHR210C 1026 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YJR023CYJR023C 402 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 VTI1YMR197C 654 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 ATX2YOR079C 942 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 BUB1YGR188C 3066 nt1.87□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 BAS1YKR099W 2436 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RRI2YOL117W 1938 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YDL187CYDL187C 330 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 VTC1YER072W 390 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 BET4YJL031C 984 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 PEP8YJL053W 1140 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RPA34YJL148W 702 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 SHE2YKL130C 741 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 HRI1YLR301W 735 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RPS22BYLR367W 393 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.86□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.85□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RPL29YFR032C-A 180 nt1.85□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YGR226CYGR226C 210 nt1.85□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 TRS20YBR254C 528 nt1.85□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RUD3YOR216C 1455 nt1.85□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 NDD1YOR372C 1665 nt1.85□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YNL144CYNL144C 2223 nt1.85□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 AHC2YCR082W 387 nt1.84□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 SLX9YGR081C 633 nt1.84□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 YIL058WYIL058W 285 nt1.84□□□□□ -2.11
VIK1Q12045 RPL40AYIL148W 387 nt1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms