Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ABCC8Q09428 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC8Q09428 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms