Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RBL2Q08999 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RBL2Q08999 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms