Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNB2Q08289 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNB2Q08289 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms