Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACTN3Q08043 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ACTN3Q08043 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms