Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN1BQ07699 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN1BQ07699 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms