Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FMODQ06828 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms