Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAX8Q06710 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms